DnkSet

DnkSet

Программа DnkSet осуществляет поиск и локализацию различных классов повторов (прямых, инвертированных, зеркальных и комплиментарных; содержащих ошибки) на последовательности ДНК, а также любой другой последовательности, состоящей из букв или символов (РНК, белки, литературный или другой тексты).

Общие характеристики:

Размер анализируемой последовательности - до 300 000 нуклеотидов (или других символов).
Длина повторов - от 5 до 40 нуклеотидов (или других символов).
Число ошибок в повторе - от 0 до 10 нуклеотидов (или других символов).
Функции:

Поиск и локализация различных классов повторов (прямых, инвертированных, зеркальных и комплиментарных; содержащих ошибки);
Поиск повторов с маской (фиксированное положение ошибки).
ЗАМЕЧАНИЕ: в демонстрационном варианте ряд параметров ограничен или отсутствует